Prvním badatelem, který se zabýval problematikou Žižkova rodiště, byl borovanský rodák, právník a historik Jiří Petřík. Svůj výzkum zahájil na místě údajné studánky Jana Žižky, která se ukázala být studnou o průměru 175 cm a hloubce téměř 9 metrů.

Ve výplni této studny bylo nalezeno velké množství keramiky, kterou bylo možné datovat od 14. do 17. století, v podobě celých nádob a dokonce zbytek dřevěného džberu na nabírání vody. Dodnes tyto nálezy tvoří základ fondu Trocnov, část byla použita při tvorbě nové expozice a zbytek je uložen v depozitářích Jihočeského muzea.

Počátky založení Trocnova spadají do druhé poloviny 14. století. Jan Žižka statky prodal v roce 1378 a od té doby až do roku 1425 byly spojeny v rukou pánů z Dvorce, kteří statky pronajímali sedlákům. V roce 1484 byly prodány augustiniánskému klášteru v Borovanech. Po jeho zániku v roce 1579 se Trocnov stal součástí rozsáhlého panství Rožmberků a v průběhu druhé poloviny 17. století statky zanikají.

Po odstranění stávající roubené konstrukce bylo při průzkumu odhaleno svrchní kamenné zdivo kruhové studny. Dobrovolní hasiči z Borovan odčerpali vodu a speleolog provedl podrobný průzkum a detailní dokumentaci historického podzemního objektu. Ve studni byla zjištěna kruhová kamenná konstrukce, ve spodních částech studny velice pečlivě vyskládaná.

Studna byla přesně změřena – hloubka studny je dnes necelých 6,5 metrů s tím, že nebylo dosaženo dna studny. Na dně byly zachyceny spadané větve z okolního terénu a napadaný novověký materiál. Studna nebyla čištěna, a tak nedošlo na jejím dně k archeologickým nálezům keramického ani jiného archeologického materiálu.

Technicky nebyla studna žádným způsobem narušena, pouze na některých místech, obzvláště v horní části byly otvory buď po vypadaných kamenech, nebo snad i po konstrukci používané při její stavbě. Studna byla vystavěna v jedné etapě a její počátek souvisí se vznikem Mikšova dvorce ve 14. století.

Po této dokumentaci vznikne 3D model studny, který bude prezentován v rámci expozice v Trocnově a práce bude součástí celého komplexu nedestruktivního archeologického výzkumu před výstavbou a realizací středověkého skanzenu v Trocnově.