Co se týče klíšťové encefalitidy, není možné vzhledem k dosavadnímu nízkému výskytu určit okresy s největším výskytem, zatím nejvíce případů, a to tři, je evidováno na Českobudějovicku, Českokrumlovsku a Strakonicku, po dvou na Strakonicku a Jindřichohradecku a po jednom na Písecku a Táborsku.

U lymeské boreliózy je zatím největší výskyt evidován na Českobudějovicku, a to sedmnáct, deset na Jindřichohradecku a dvět na Táborsku. Další případy jsou evidovány na Českokrumlovsku, Písecku, na Prachaticku tři a na Strakonicku jeden potvrzený případ.

Srovnáme-li letošní výskyt se stejným obdobím loňského roku, letos je prozatím hlášeno méně klíšťové encefalitidy (vloni v tomto období 16 případů), stejně tak lymeské boreliózy je poněkud méně (vloni 53, letos 51).

Největší výskyt klíšťové encefalitidy evidovali jihočeští hygienici v roce 2011, tehdy onemocnělo v regionu celkem 170 osob a v celé republice 861 osob. Nejvíce případů lymeské boreliózy bylo v kraji zaznamenáno v roce 2013, a to 317 nahlášených a potvrzených případů.